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南极栖海洋菌-苏云金芽孢杆菌SHMCCD51310ivcas7.00504-星海湾链霉菌

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dNTP Mix是一种由 dATP、dCTP、dGTP 和 dTTP 组成的等摩尔混合溶液

Tn5转座酶是一种能够高效切割并插入DNA的酶,广泛应用于基因组编辑和高通量测序文库构建。它通过识别特定的DNA序列并将其插入到目标DNA中,实现基因组的“跳跃”和重组。 工作原理 Tn5转座酶的工作原理包括以下几个步骤: 复合物形成:两个Tn5转座酶分子结合到供体DNA的转座子的ME序列,形成复合物。 切割与插入:在Mg²⁺存在的情况下,Tn5转座酶切割供体DNA,并将其插入到靶DNA中,形成转座后的DNA序列。 结果:切割形成的9bp粘性末端可通过DNA聚合酶和连接酶填补,最终形成9bp正向重复序列。 应用场景 NGS文库构建:Tn5转座酶能够将DNA片段化并直接连接测序接头,简化了传统的文库构建步骤,显著提高了建库效率。 单细胞测序:通过LIANTI技术,Tn5转座酶可用于单细胞DNA建库,实现微量DNA的高效扩增。 ATAC-seq:用于研究染色质可及性,通过将DNA序列插入开放的染色质区域,检测全基因组范围内的染色质开放程度。 CUT&Tag:结合Protein A/G,Tn5转座酶可用于切割靶蛋白结合的染色质区域,并直接插入测序接头,用于研究蛋白质-DNA相互作用。

Ultra-Long DNA Polymerase在扩增超长片段时表现出色,能够显著提高产物的产量

在分子生物学实验中,DNA凝胶电泳是一种常用的技术,用于分离和分析DNA片段。而6×DNA Loading Buffer则是这一实验中不可或缺的重要试剂。 6×DNA Loading Buffer是一种六倍浓缩的上样缓冲液,主要用于DNA凝胶电泳。它含有甘油、EDTA、溴酚蓝和二甲苯青FF等成分。其中,甘油可以增加样品的密度,使样品沉入凝胶加样孔中,防止样品漂浮;EDTA则用于螯合金属离子,防止DNA降解。溴酚蓝和二甲苯青FF作为指示剂,分别指示电泳的进程,帮助实验者判断电泳是否达到最佳分离效果。 使用6×DNA Loading Buffer时,通常按照1:5(Loading Buffer:DNA样品)的比例混合。例如,对于5μL的DNA样品,加入1μL的6×Loading Buffer,混匀后即可加样。这种缓冲液适用于多种浓度的琼脂糖凝胶,溴酚蓝在0.6%、1%、1.4%和2%琼脂糖凝胶中的迁移率分别与1Kb、0.6Kb、0.2Kb和0.15Kb的双链线性DNA片段大致相同。

对于小于500 bp的DNA片段,检测信号可能较弱,建议使用其他染料如SYBR Green I。

在生命科学领域,Taq DNA Polymerase犹如一颗璀璨的明珠,闪耀着独特的光芒。它是一种耐热的DNA聚合酶,最初是从一种嗜热细菌——栖热水生菌(Thermus aquaticus)中分离出来的。这种细菌生活在高温的温泉环境中,而Taq酶也因此具备了在高温下稳定工作的能力,这使得它在分子生物学实验中扮演了不可或缺的角色。 Taq DNA Polymerase的主要功能是催化DNA的合成。在聚合酶链式反应(PCR)中,Taq酶的作用尤为关键。PCR是一种用于快速扩增特定DNA片段的技术,它通过反复的变性、退火和延伸三个步骤来实现DNA的指数级扩增。在变性阶段,DNA双链被高温分离成单链;退火阶段,引物与模板DNA结合;而在延伸阶段,Taq酶便大显身手。它能够以单链DNA为模板,从引物的3'端开始,按照碱基互补配对原则,将一个个脱氧核苷酸添加到新链上,从而合成与模板互补的DNA链。由于Taq酶在高温下仍能保持活性,这使得PCR反应可以在较高的温度下进行,大大提高了反应的特异性和效率。

dNTP Set Solution广泛应用于多种分子生物学实验,如基因扩增、cDNA合成等

在分子生物学实验中,DNA的完整性和准确性是实验成功的关键。Uracil-DNA Glycosylase(UDG)是一种能够特异性识别并修复DNA中尿嘧啶(U)的酶,广泛应用于PCR反应和其他DNA合成实验中。然而,传统的UDG在反应结束后需要额外的处理步骤来失活酶活性,以防止对后续实验的干扰。热敏感型UDG(Heat-labile UDG,1U/μl)的出现,为这一问题提供了高效的解决方案。 热敏感型UDG的独特特性 热敏感型UDG(Heat-labile UDG)是一种经过工程改造的UDG,来源于细菌。与传统的UDG不同,这种酶在高温条件下(通常在95℃)会迅速失活。这一特性使其在PCR反应中具有显著优势。在反应开始前,UDG可以有效去除引物或模板中的尿嘧啶,防止非特异性扩增。而在PCR反应的高温变性步骤中,UDG会自动失活,无需额外的处理步骤,从而简化了实验流程。 热敏感型UDG的应用 热启动PCR:在PCR反应中,热敏感型UDG可以用于防止引物二聚体的形成和非特异性扩增。通过在反应前加入UDG,可以降解引物中的尿嘧啶,从而避免引物在反应前的非特异性结合。

SYBR Green I是qPCR中常用的荧光染料,能够实时监测DNA扩增过程,广泛用于基因表达分析

在分子生物学研究中,长片段DNA扩增是许多实验的关键步骤,但传统PCR方法在扩增较长片段时常常面临效率低、特异性差等问题。Ultra-Long Master Mix (2×) (Without Dye)的出现,为这一难题提供了高效的解决方案。 Ultra-Long Master Mix (2×) (Without Dye)是一种专为长片段DNA扩增设计的预混反应体系。它以Ultra-Long DNA Polymerase为核心,这种聚合酶融合了多种酶的特性,能够在单次反应中高效扩增长达40 kb甚至更长的DNA片段。这种能力使其在基因组学研究、全基因合成以及复杂基因组区域的分析中具有无可比拟的优势。 该Master Mix的“2×”浓度设计意味着实验人员只需将模板DNA、引物和水加入其中,即可快速配制好反应体系。这种预混液不仅简化了操作流程,还减少了人为误差,确保了反应体系的均一性和稳定性。此外,无染料配方为后续实验提供了更大的灵活性。实验人员可以根据需要选择是否添加染料,或者直接用于下游应用,如克隆、测序或无染料的凝胶电泳分析。

样品混合:将 2 μL 的 3×甲酰胺凝胶上样缓冲液与 4 μL 的核酸样品混合。

在荧光定量PCR(qPCR)实验中,准确的荧光信号检测是实验成功的关键。50× ROX Reference Dye作为一种常用的被动参考染料,为qPCR实验提供了重要的校准功能,确保了荧光信号的准确性和稳定性。 ROX Reference Dye的作用机制 ROX染料是一种被动参考荧光染料,其主要作用是校正qPCR反应中的非特异性荧光背景和孔间荧光信号的差异。在qPCR实验中,荧光信号的强度可能会受到多种因素的影响,如仪器的荧光检测系统的波动、反应体系的差异以及孔间位置的差异等。ROX染料通过提供一个稳定的荧光背景,帮助校正这些非特异性信号,从而提高定量结果的准确性和重复性。 50× ROX Reference Dye的应用 荧光定量PCR(qPCR):在qPCR实验中,ROX染料通常以一定比例添加到反应体系中。它不会参与PCR反应,但会提供一个稳定的荧光背景,用于校正仪器检测到的荧光信号。通过校正,可以更准确地反映目标基因的扩增情况,从而提高定量结果的可靠性。 多重qPCR:在多重qPCR实验中,ROX染料的作用尤为重要。

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